Extraiga y ordene números de nombres de archivo en python

La mejor manera es usar expresiones regulares. Para obtener el valor del nombre del archivo:

m = re.search(filename, '^Dipole_E0=(.*)/s?')
val = m.group(0)

Recorra todos los nombres de dile y agregue todos los valores a la matriz. Después de ese tipo y eso es todo.

Quiere buscar expresiones regulares. En python viven en el módulo re. Dependiendo del formato exacto, algo como:

import re
ematch = re.compile("=([0-9]*\.[0-9]*[eE][+-][0-9]+)")
val = ematch.search(filename).group(0)

La clasificación de una lista se puede hacer con el método .sort() en las listas, o con el método integrado ordenado (lista), que le brinda una nueva lista.

Esta es una buena situación para usar un expresión generadora y el sorted incorporado:

sorted(float(filename.split("=", 1)[1].rsplit(".", 1)[0]) for filename in filenames)

Dónde filenames es su lista de nombres de archivo.

>>> filenames = ["Dipole_E0=1.2625E-01.dat", "Dipole_E0=1.3625E-01.dat", "Dipole_E0=0.2625E-01.dat"]
>>> sorted(float(filename.split("=", 1)[1].rsplit(".", 1)[0]) for filename in filenames)
[0.02625, 0.12625, 0.13625]

Puede obtener los nombres de archivo con el módulo glob.

    from glob import glob
    file_names = glob("yourpath/*.dat")

    vals = []
    for name in file_names:
         vals.append(float(name[:-4].rpartition("=")[2]))

    vals.sort()            

name[:-4] tira el ".dat". rpartition es un método de cadena. Devuelve una tupla donde la entrada 0 es la cadena a la izquierda de la cadena utilizada para dividir, la entrada 1 es la cadena utilizada para dividir (aquí: "=") y la entrada 2 es la cadena a la derecha de esta cadena (aquí: su flotador). Luego se convierte en un flotante y se agrega a la lista de valores.