Python, ¿tratando de obtener información del subproceso?

Esta no es realmente la mejor manera de tener comunicación entre procesos, le recomiendo que use las bibliotecas de subprocesos o multiprocesamiento con algo como una Cola o PIPE para comunicación y sincronización.

una cola sería la forma más sencilla de compartir datos, un proceso pondría un valor y otro obtendría los valores.

Modifiqué su código original para que funcione ahora, tenga en cuenta que raw_input no vacía stdout como tal si no hay nada allí, se bloqueará, http://code.activestate.com/lists/python-list/265749/ es por eso que su código solo estaba esperando la salida estándar ...

ESTO ES PELIGROSO, puede generar interbloqueos, utilícelo bajo su propio riesgo, pruebe con otro método.

import sys
print 'Whats your favorite animal\n' #raw_input doesn't flush :( and we want to read in a whole line
sys.stdout.flush()
f = raw_input()
print f

y el correspondiente main.py

import subprocess, sys, os
process = subprocess.Popen([sys.executable]+['example.py'],
     stdout = subprocess.PIPE, stderr = subprocess.PIPE, stdin = subprocess.PIPE)

while True:
    if process.poll() != None:
        break
    request_input = process.stdout.readline() # read line, this will wait until there's actually a line to read.
    if request_input == "Whats your favorite animal\n":
        print 'request: %s sending: %s' % (request_input, 'cat')
        process.stdin.write('cat\n')
       process.stdin.flush()

Edit: Parece que no entendí bien tu pregunta, lo siento.

Esto no es tan fácil como podrías pensar:

Tienes que usar select para comprobar si hay datos disponibles en stdin, si hay datos, ¡léelos!

Ejemplo mínimo:

STDIN, STDOUT = 0, 1

while not process.poll() is None:
    out = process.stdout.read(1)

    if not out:
        break

    try:
        fds = select.select([STDIN], [], [])[0]
    except select.error:
        pass
    else:
        if STDIN in fds:
            data = os.read(STDIN, 1024)

            if data_requested:
                process.stdin.write(data)

Información para seleccionar: http://docs.python.org/library/select.html#module-select, http://linux.die.net/man/2/select y http://en.wikipedia.org/wiki/Select_(Unix)

No estoy seguro de si esto funcionará en Windows, ya que Windows solo admite select en enchufes. Pregunta relevante sobre SO: ¿Cuál es el mejor equvalor epoll / kqueue / select en Windows?

Trate de usar el módulo de multiprocesamiento

from multiprocessing import Process, Value, Array

def f(n, a):
    n.value = 3.1415927
    for i in range(len(a)):
        a[i] = -a[i]

if __name__ == '__main__':
    num = Value('d', 0.0)
    arr = Array('i', range(10))

    p = Process(target=f, args=(num, arr))
    p.start()
    p.join()

    print num.value
    print arr[:]

A menos que insista en "Python sin procesar", lo mejor es usar el módulo pexpect. He agregado una salida a su ejemplo.py, de lo contrario, no es nada divertido.

Aquí está ejemplo.py:

    f=raw_input('WHats your favorite animal')
    print f.upper()

Aquí está pexpect-example.py que está buscando:

    # see http://pexpect.sourceforge.net/pexpect.html
    import pexpect

    PY_SCRIPT = 'example.py'

    child = pexpect.spawn('python %s' % PY_SCRIPT)

    child.expect ('WHats your favorite animal')

    # comment out these three lines if you run unmodified example.py script
    child.setecho(False)
    child.sendline ('cat')
    print PY_SCRIPT, 'said:', child.readline()