Preguntas con respuestas sobre "imagej"

29 preguntas, página #1

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ImageJ - Imagen para apilar en lote

Tengo archivos .tiff que contienen 25 secciones de una pila cada uno. ¿Hay alguna forma de usar el comando "Imagen para apilar" por lotes? Cada conjunto de datos contiene 60 tiffs para los tres canales de color. ...

preguntado 10 años, 7 meses

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R / ImageJ: medición de la distancia más corta entre puntos y curvas

Tengo algo de experiencia con R como plataforma de estadísticas, pero no tengo experiencia en matemáticas basadas en imágenes. Tengo una serie de fotografías (se conoce el formato tiff, px / µm) con huecos y curvas irregulares. Me gustaría medir la distancia más corta entre un agujero y la curva más cercana para ese agujero en particular. ...

preguntado 10 años, 10 meses

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Cómo depurar en frascos cargados dinámicamente en IntelliJ

Estoy escribiendo un complemento para ImageJ, con un script Ant para poner todos los archivos necesarios en un frasco. ImageJ carga todos los frascos en un directorio y ejecuto mi complemento. Sin embargo, cuando trato de depurar mi programa, IntelliJ afirma que "No se encontró código ejecutable en la línea x en la clase y". ¿Cómo podría hacer ...

preguntado 10 años, 11 meses

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Java: ¿cómo agregar un oyente en el complemento ImageJ?

Estoy escribiendo un complemento para ImageJ que escanea los píxeles de una línea deseada en busca de brillo sobre una serie de cuadros en un video AVI. Los datos se muestran en un gráfico 2D para el fotograma de video activo, los píxeles en el eje xy la intensidad en el eje y. ...

preguntado 11 años, 4 meses

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¿Cómo depurar un complemento ImageJ en Emacs usando el entorno JDEE?

Actualmente estoy desarrollando un complemento para ImageJ, está basado en Java. No estoy muy familiarizado con Java ya que solía ser desarrollador C / C ++. Parece que la depuración del programa Java tiene muchas diferencias en comparación con el uso de GDB / GUD en emacs. Sé que puedo usar Eclipse para lidiar con la depuración, pero simplemente no lo hago ...

preguntado 11 años, 5 meses

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Creación de accesos directos del complemento de archivo jar de ImageJ

He estado trabajando en un proyecto de biología del desarrollo marcando varios marcadores nucleares junto con una tinción DAPI para determinar el porcentaje de expresión del marcador. Descubrí que el complemento ImageJ ITCN (http://rsbweb.nih.gov/ij/plugins/itcn.html) funciona muy bien para cada marcador cuando también se usa CLAHE ...

preguntado 11 años, 10 meses

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ImageJ Brillo y contraste sobre una pila de imágenes

Estoy mirando un conjunto de datos de imágenes en ImageJ (una pila de imágenes .tif, alrededor de 130 cuadros) y tengo un problema con el conjunto de datos. Es una serie de imágenes microscópicas, cada cuadro es un plano de aproximadamente 3-4 micrómetros por encima / por debajo del anterior. A medida que profundizo en el conjunto de datos, la luz ...

preguntado 11 años, 11 meses

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Guardar y acceder a muchos polígonos de ROI (IDL, ImageJ, Java ?, ¿XML?)

Necesito guardar y volver a cargar miles de polígonos de ROI en una pila de imágenes, en realidad una película de 30 fotogramas por segundo durante más de 30 minutos, por lo que al menos 54,000 fotogramas. Puede haber múltiples ROI en una sola imagen (marco) en la pila, y el tamaño y la cantidad de vértices para cada ROI es diferente. El ROI ...

preguntado 12 años, 9 meses